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黃海所研制出基因芯片“黃海芯1號” 助力對蝦育種

2021-6-23 10:28| 發布者: 御城雪| 查看: 89724| 評論: 0|來自: 黃海水產研究所育種室

摘要: 中國水產頻道報道,孔杰研究員團隊研制出基因芯片“黃海芯1號”助力對蝦育種。
  中國水產頻道報道,

  孔杰研究員團隊研制出基因芯片“黃海芯1號”助力對蝦育種

  基因芯片是提升育種效率、培育抗病、抗逆及優質等新品種的重要分子工具。近年來,針對對蝦基因組育種缺乏低成本、高通量的基因芯片現狀,中國水產科學研究院黃海水產研究所孔杰研究員團隊研制出40K SNP基因芯片“黃海芯1號”。依據多代系譜,采用一步法基因組選擇技術,“黃海芯1號”已經應用于對蝦的商業化育種中,在提高致急性肝胰腺壞死病副溶血弧菌(VpAHPND)、白斑綜合征病毒(WSSV)抗性和生長速度等方面取得顯著進展。

  研究團隊對世界上重要對蝦養殖群體和品系進行了全基因組重測序,獲得6百萬個有效SNP標記,經過整合WSSV抗性、氨氮耐受性、飼料轉化效率等相關SNP位點,選留45815個標記并構建了液相芯片。利用該芯片的基因型檢測結果,對VpAHPND和WSSV侵染的抗性開展一步法基因組選擇,準確性比傳統的BLUP方法高29%-91%。該團隊已經與石家莊博瑞迪生物技術有限公司簽約,聯合開展育種技術服務與SNP基因型檢測服務。目前,“黃海芯1號”已推廣應用于4個凡納濱對蝦的遺傳育種項目,分型個體數量超過2000尾。

  對蝦40K SNP育種芯片“黃海芯1號”的研發,為凡納濱對蝦基因組親緣關系鑒定、遺傳結構與遺傳多樣性分析、多性狀基因組選擇等提供了重要工具,對進一步推動對蝦種業的快速發展起到至關重要的作用。

  圖1,“黃海芯1號”對蝦基因芯片的SNP位點分布圖

  圖2,世界上主要對蝦品系的“黃海芯1號”聚類圖

  圖3,世界上主要對蝦品系的“黃海芯1號”親緣關系熱圖本文轉自【黃海水產研究所育種室】。如有版權問題,敬請聯系wx@fishfirst.cn



  【關鍵字】:對蝦  基因芯片  育種  水產養殖
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